Dopo aver visto suo padre morire in un duello contro un imbattibile malvagio noto solo come "Giustizia", il giovane Afro fissa la sua vita sullo studio delle spade e della vendetta. La storia di Afro Samurai è una storia di sanguinose difficoltà e dolore. Lungo il suo solitario percorso di vendetta per il padre assassinato, non versa lacrime e non conosce l'amore. Inseguito da potenti nemici in una distopia senza legge e macchiata di tecnologia, schiva proiettili e lame per raggiungere la sua preda finale: un uomo che non morirà. Ma Afro raggiungerà la sua preda, anche se ciò significa dipingere una strada di sangue e cervelli da qui all'amara inevitabile fine.