Remake della serie del 1963. A.D. 2030: nella megalopoli di Tokyo, Astroboy, creato dal Ministro della Scienza dottor Tenma, combatte in nome della giustizia contro Atlas, un super androide munito del "Fattore Omega", un circuito che riflette in lui il lato oscuro dell'animo umano. Atlas, che ha portato il suo creatore, il barone Walpul Giss, alla rovina, sviluppa le sue capacità diventando un potente robot, costruendo poi una base chiamata "Crystal" e sfidando Astroboy a duello.