All'inizio degli anni '30 a Chicago, il treno transcontinentale Flying Pussyfoot inizia il suo leggendario viaggio che lascerà una scia di sangue in tutto il paese. Allo stesso tempo, a New York, l'ambizioso scienziato Szilard e il suo riluttante aiutante Ennis, sono alla ricerca delle bottiglie mancanti dell'elisir dell'immortalità. Inoltre, la guerra tra i gruppi mafiosi si sta aggravando. A bordo dell'Advena Avis, nel 1711, gli alchimisti stanno per imparare il prezzo dell'immortalità. Basato sulle pluripremiate light novel con lo stesso nome, questo adattamento anime segue diversi eventi che inizialmente sembrano non correlati, sia nel tempo che nello spazio, ma fanno parte di una storia molto più grande, fatta di alchimia, sopravvivenza e immortalità. A fondere insieme questi eventi sono gli aspiranti ladri di buon cuore, Isaac e Miria, che collegano varie persone, tutte con le proprie ambizioni e programmi nascosti, e creano legami e conseguenze per tutta la vita per tutte le persone coinvolte.