Il secondo cour del Dr. STONE: NUOVO MONDO. Anni fa, l'astronauta Byakuya ha lasciato materiali preziosi nella convinzione che un giorno suo figlio, Senkuu, dotato di talento scientifico, li avrebbe trovati. Nel presente, Kohaku e Ginrou del Regno della Scienza si sono infiltrati nell'harem del leader del Regno di Pietrificazione con l'aiuto di Amaryllis, una ragazza del posto. All'inizio, la loro missione procede senza intoppi. Sfortunatamente, un errore messo in atto da Kohaku e Ginrou porta il ministro Ibara e il guerriero più forte dell'isola, Moz, a identificare il duo intruso come nemici. Ancora peggio, Moz pedina Amaryllis quando torna per informare Senkuu della notizia, scoprendo il nascondiglio segreto dello scienziato. Tuttavia, l'agenda di Moz non è in linea con quella di Ibara: vuole detronizzare il ministro e tenere per sé il dispositivo di pietrificazione. Se Senkuu giocasse bene le sue carte, potrebbe ottenere un potente alleato e vincere la guerra una volta per tutte.