Anno 20XX. Misteriosi robot giganti chiamati GR (Giant Robots) appaiono improvvisamente in ogni parte del globo e seminano morte e distruzione. L'umanità è preda del terrore. Il prossimo obiettivo di questi enormi mostri d'acciaio è il Giappone. Il diciottenne Daisaku Kusama incontra il Giant Robot 1, un colossale robot d'acciaio di 30 metri, presso le antiche rovine di Okinawa. Egli fa un patto con una misteriosa ragazza che lo approva come comandante del GR1... Daisaku sarà suo malgrado reclutato dall'organizzazione militare "UNISOM" per fronteggiare il gruppo "GRO" (Gigantic Rebellion Operators), che estrae i misteriosi robot dalle rovine di tutto il mondo e li usa come armi di distruzione di massa.