La seconda stagione di Isekai wa Smartphone a Tomo ni. Touya Mochizuki si abitua alla sua nuova vita in un altro mondo. Armato del suo fidato smartphone, l'adolescente accetta piccole missioni a suo piacimento mentre trascorre del tempo con le sue nuove fidanzate: Yumina Urnea Belfast, Yae Kokonoe e le sorelle gemelle Linse ed Elze Shileska. Ma anche in un ambiente rilassante, Touya sta solo iniziando a capire le responsabilità che derivano da questi impegni. Oltre ai suoi guai romantici, l'anziana fata Lean desidera localizzare i pezzi rimanenti di Babilonia, l'isola galleggiante che la misteriosa professoressa Regina Babilonia ha creato cinquemila anni fa. Touya accetta con riluttanza la sua richiesta e cerca i circoli di teletrasporto che porteranno alle isole. Tuttavia, sono emersi strani mostri, forse abbastanza potenti da distruggere il mondo. Per salvare la seconda vita che gli è stata data, Touya deve armare antiche tecnologie per combattere questi mostri, il tutto bilanciando il suo numero schiacciante di relazioni.