La città giapponese immaginaria chiamata Sugomori City è costruita su un terreno bonificato. Ma con il passare degli anni, la popolazione della città sta diminuendo. Un giorno, Sonosaki dice alla sua compagna di classe Katsuhira: "Sei stata selezionata per essere una Kiznaiver". Il sistema Kizuna, che permette a Katsuhira di condividere le sue ferite, lo collega ai compagni di classe le cui vite e personalità sono completamente diverse dalle sue. Il sistema Kizuna è un sistema incompleto per l'attuazione della pace nel mondo che collega le persone attraverso le ferite. Tutti coloro che sono collegati a questo sistema sono chiamati Kiznaivers. Quando un Kiznaiver viene ferito, il sistema si divide e trasmette la ferita tra gli altri Kiznaiver.