La squadra di basket della Teikou Junior High School viene incoronata campione per tre anni di fila grazie a cinque giocatori eccezionali che, con le loro abilità mozzafiato e uniche, lasciano gli avversari nella disperazione e i fan in ammirazione. Tuttavia, dopo la laurea, questi compagni di squadra, conosciuti come "La Generazione dei Miracoli", prendono strade separate e ora si considerano rivali. Alla Seirin High School, due matricole appena assunte dimostrano di non essere normali giocatori di basket: Taiga Kagami, un promettente giocatore di ritorno dagli Stati Uniti, e Tetsuya Kuroko, uno studente apparentemente normale la cui mancanza di presenza gli permette di muoversi inosservato. Sebbene Kuroko non sia né atletico né in grado di segnare punti, era un membro della squadra di basket di Teikou, dove giocava come il "Sesto uomo fantasma", che passava facilmente la palla e assisteva i suoi compagni di squadra. Kuroko no Basket segue il viaggio dei giocatori di Seirin nel tentativo di diventare la migliore squadra del liceo giapponese vincendo l'Interhigh Championship. Per raggiungere il loro obiettivo, devono incrociare diverse potenti squadre, alcune delle quali hanno uno dei cinque giocatori con abilità divine, che Kuroko e Taiga fanno un patto per sconfiggere.