Quando la tragedia colpì Riki Naoe da bambino, fu salvato dal dolore per la morte dei suoi genitori quando altri quattro bambini lo "reclutarono" per il loro gruppo, i "Little Busters". Ora al liceo, Riki e gli altri Buster sono ancora amici e, anche se la loro visione di essere eroi per la giustizia potrebbe essere svanita, farebbero ancora qualsiasi cosa l'uno per l'altro. Ecco perché Riki è ora impegnato in DUE missioni speciali. Quello non così segreto: reclutare nuovi membri in modo che i Busters possano formare una squadra di baseball. Preferibilmente reclute FEMMINE, poiché l'attuale rapporto uomo/ragazza è uno scomodo 4 a 1. L'ALTRA missione, però... Questo è quello strano. Perché Riki e Rin, la singolare ragazza del gruppo, ricevono strani messaggi, consegnati da gatti, riguardanti l'esistenza di un "mondo segreto" e assegnano loro dei compiti da completare. I loro sogni giovanili di essere crociati non erano poi così fantasiosi? O c'è qualcosa di ancora più vitale in gioco? Tra il coraggio di parlare con le ragazze, l'affrontare la propria narcolessia e i sentimenti che prova per Rin, Riki potrebbe aver bisogno della forza di un supereroe per risolvere il mistero definitivo dei Little Busters!