Sono passati quattro anni dalla battaglia finale tra l'Essere Celeste e le Forze dell'ONU. L'umanità, avendo istituito la Federazione della Sfera Terrestre, forma una forza indipendente di conservazione della sicurezza, A-Laws, separata dall'esercito formale della Federazione per unificare ulteriormente le nazioni e la volontà dell'umanità. Ma la realtà era l'oppressione disumana dell'uso improprio dei poteri, delle dottrine e delle ideologie in nome dell'unità. Saji Crossroad ha seguito la strada per diventare un ingegnere spaziale per mantenere la promessa fatta a Louise Halevy, che a sua volta è stata costretta a partecipare alla riforma del governo della Federazione e si è unita ad A-Laws come pilota di mobile suit durante i quattro anni di pausa. Nel frattempo, Setsuna F. Seiei, sopravvissuta alla battaglia culminante di quattro anni prima, ha assistito a un cambiamento nel mondo a causa delle azioni dell'Essere Celeste. Con la sconfitta di Alejandro Corner, sognava un mondo pacifico e senza conflitti; ma davanti ai suoi occhi c'era la realtà della continua tensione per la pace, l'oppressione causata dagli A-Laws. Decide ancora una volta di combattere con Gundam, il potere con il potenziale per cambiare il mondo.