Nel 21° secolo, gli alieni sono arrivati sulla Terra e vivono tra gli esseri umani. Nella sonnolenta Enohana, la povera studentessa Chigasaki Mayuko si ritrova a vivere insieme a NieA, un'aliena di bassa casta ("Under Seven"). Mentre Mayuko lotta diligentemente per sbarcare il lunario, NieA sembra essere totalmente indifferente alle conseguenze delle sue azioni. Mentre la strana coppia lancia le scintille previste, la nave madre aliena naufragata incombe sullo sfondo...