Nell'anno 2999: l'umanità è divisa in due fazioni, Terra e Ness, in una guerra combattuta da astronavi. Uno dei piloti più importanti è l'adolescente arrogante Yamamoto Yohko, e durante una delle sue missioni, lei e il suo equipaggio vengono risucchiati in un'anomalia temporale (alla Star Trek) che la rimanda indietro nel nostro tempo. Amnesica, pensa a se stessa solo come a una tipica studentessa delle superiori, fino a quando un corso di eventi la rimanda alla sua nave, la TA-29, con i suoi nuovi amici che combattono al suo fianco in una guerra che assomiglia in modo sospetto a un gioco arcade (completo di costi di accensione di 100 yen!).