La Cross Academy è un collegio d'élite con due classi separate e isolate: la classe diurna e la classe notturna. In superficie, Yuuki Cross e Zero Kiryuu sono i prefetti dell'accademia e cercano di mantenere l'ordine tra gli studenti mentre le lezioni ruotano la sera. Poiché la classe serale è piena di élite assolutamente meravigliose, questo a volte può rivelarsi un po' difficile. È del tutto necessario, tuttavia, poiché quelle "élite" sono in realtà vampiri. Yuuki e Zero agiscono come guardiani, proteggendo i segreti della Night Class e la sicurezza dell'ignorante classe diurna. In qualità di figlia adottiva del presidente dell'accademia, Yuuki prende il suo lavoro con un atteggiamento serio ed energico. Le permette anche di interagire con la sua cotta segreta e salvatrice, il presidente del dormitorio della classe serale, Kaname Kuran. Zero, d'altra parte, ha un odio profondamente radicato contro i vampiri e, a volte, non esita a uccidere. Riusciranno i vampiri e gli umani a coesistere, anche nella rigida configurazione della Cross Academy? Solo il tempo lo dirà.