Mirai, un cacciatorpediniere lanciamissili Aegis di classe Kongou migliorato, è una delle navi più nuove e avanzate dell'intera Forza di autodifesa giapponese (SDF). Il suo equipaggio, anch'esso uno dei più recenti, è guidato dal capitano Umezu Saburo e dall'ufficiale esecutivo Kadomatsu Yosuke. Un giorno, durante l'esecuzione di esercitazioni programmate, Mirai incontra una violenta tempesta che getta i loro sistemi di navigazione in un temporaneo disordine. Dopo alcuni minuti di recupero, l'equipaggio è scioccato nello scoprire di essere stato trasportato indietro nel tempo al 4 giugno 1942, la battaglia delle Midway, durante la seconda guerra mondiale. Lasciando che la storia faccia il suo corso per questa battaglia, riescono a evitare il conflitto in prima persona e fanno voto di rimanere infastiditi, cambiando la storia il meno possibile. Tuttavia, quando l'equipaggio si imbatte nel tenente comandante morente Kusaka Takumi, XO. L'istinto di Kadomatsu di salvare vite umane prende il sopravvento, cambiando il corso della storia più di quanto avrebbe potuto immaginare.